Penelitian ini bertujuan mengetahui, mendeskripsikan : (1) konteks internalisasi nilai-nilai budaya dan karakter bangsa melalui mata pelajaran Pendidikan Agama Islam (2) Sumber daya sekolah yang mendukung proses internalisasi (3)  proses pembelajaran dalam internalisasi nilai-nilai budaya dan karakter bangsa dan (4) mendeskripsikan nilai karakter yang diwujudkan dalam sikap dan perilaku peserta didik. Sasaran penelitian ini adalah SMA eks RSBI yaitu  SMA Negeri 1 Kudus dan SMA Negeri 1 Jepara, Provinsi Jawa Tengah. Penelitian ini menggunakan pendekatan kualitatif, dengan menerapkan desain penelitian model CIPP (Context, Input, Process, And Product). Temuan dari penelitian internalisasi nilai-nilai budaya dan katakter bangsa pada mata pelajaran Pendidikan Agama Islam di SMA Negeri 1 Kudus dan SMA Negeri 1 Jepara meliputi beberapa aspek, yaitu aspek konteks, input, proses, dan produk. Secara konteks internalisasi nilai-nilai karakter bangsa akan berhasil dengan adanya sistem dan iklim yang didukung oleh masing-masing sekolah tersebut. Sistem dan iklim yang mendukung tersebut antara lain adalah kebijakan-kebijakan kepala sekolah. Kepala sekolah membuat regulasi yang mendukung implementasi pendidikan karakter, dan ditunjang dengan sarana prasarana serta budaya sekolah.  Aspek input yang ikut menentukan internalisasi nilai-nilai karakter bangsa pada kedua sekolah ini adalah kualitas dari sumber daya sekolah yang meliputi kepala sekolah, pendidik, tenaga kependidikan, peserta didik dan sarana prasana pendidikan. Proses internalisasi nilai-nilai karakter bangsa disekolah ini dilaksanakan melalui integrasi pada mata pelajaran Pendidikan Agama Islam dan mata pelajaran lainnya, baik melalui pembelajaran intrakurikuler, ekstrakurikuler, maupun ko kurikuler dan budaya sekolah. Silabus dan RPP pada mata pelajaran Pendidikan Agama Islam telah berwawasan pendidikan karakter bangsa. Adapun aspek produk dari internalisasi niali-nilai budaya dan karakter bangsa adalah peserta didik yang telah bersikap dan berperilaku sesuai dengan nilai-nilai budaya dan karakter bangsa seperti nilai religius, jujur, toleransi, disiplin, cinta damai, peduli sosial, demokratis, dan sebagainya.

Kata kunci : Internalisasi, Pendidikan Karakter, SMA eks. RSBI